แม้จะมีประเด็นตัดสินค้านสายตา เกิดขึ้นกับทัพนักกีฬาหมากรุกทีมชาติไทย ที่ลงแข่งขันหมากรุกเขมร ทั้งในแมตช์ที่ ทัพฟ้า คำหน่อแก้ว เสมอกับซก ลิมเฮง นักกีฬาเจ้าภาพ ทั้งที่มีสิทธิ์ที่จะชนะ แต่นักกีฬาของเจ้าภาพได้ทำการประท้วงว่านักกีฬาของไทย เดินหมากล้มบ่อย ทำให้ ซก ลิมเฮง ไม่ขอเดินต่อ จนสุดท้ายกรรมการตัดสินปรับให้เสมอกันไป
และประเด็นที่นักกีฬาของเวียดนามทำฟาวล์เเต่กรรมการรอบโต๊ะบอกมองไม่เห็น ทำให้ไทยแพ้ไป แม้จะประท้วงไปแล้วแต่คณะผู้ตัดสินยืนยันผลตามเดิม โดยให้เหตุผลว่า ทัพฟ้า ยอมเล่นต่อจนครบเวลา ซึ่งตามกติกาหากมองว่าฟาวล์ นักกีฬาจะต้องไม่เดินหมากต่อ ซึ่งตอนที่เกิดปัญหานั้น คุณสหพล นาควานิช นายกส.หมากรุกสากลไทย ให้สัมภาษณ์ว่า ตนและสต๊าฟฟ์โค้ชของไทยถูกไล่ออกจากห้อง ทำให้ไม่สามารถเข้าไปช่วยทัพฟ้าได้
อย่างไรก็ตาม ในแง่ของเจ้าภาพ พวกเขาเผยว่าผลตอบรับการจัดการแข่งขันหมากรุกเขมรเป็นไปในทางที่ดีกว่าที่คิด โดยข่าวที่เผยแพร่ในเว็บไซต์อย่างเป็นทางการของการแข่งขันซีเกมส์ หรือ https://www.cambodia2023.com/ ระบุว่า ทุกชาติชื่นชมมาว่า กัมพูชาจัดการแข่งขันได้อย่างดีเยี่ยม เหมือนกับการแข่งขันในระดับสากล และ ทุกอย่างเป็นไปอย่างมีระเบียบ โปร่งใส ตั้งแต่การจับสลากแบ่งสาย
โดยนาย คุช คิมลอง ประธานสหพันธ์หมากรุกกัมพูชา เผยว่า "เราได้รับคำชมอย่างมาก ยกตัวอย่างชาติล่าสุดคือฟิลิปปินส์ พวกเขาบอกว่าคุ้มค่ากับการตื่นแต่เช้ามาจับสลาก เพราะได้เห็นการบริหารจัดการที่ยอดเยี่ยม และ พวกเขามีความสุขมากที่ได้มาแข่งขันที่นี่"
ส่วนในประเด็นที่ยังมีบางชาติ ไม่เข้าใจเกี่ยวกับกติกาการแข่งขันนั้น ประธานส.หมากรุกกัมพูชา ชี้แจงว่า
"เราได้ให้เอกสารเกี่ยวกับกฎกติกาการแข่งขันไปกับทั้ง 7 ชาติที่ลงแข่งไประยะนึงแล้ว นั่นหมายความว่าทุกชาติมีเวลาในการทำความเข้าใจกับกติกาทั้งหมด"
ขณะที่นายกสมาคมของไทย บอกอีกว่าในแมตช์ที่ผ่านมาก็ต้องน้อมรับคำตัดสินไปตามนั้น แต่จะเก็บไว้เป็นบทเรียนและทำให้ดีขึ้นในแมตช์ต่อๆไปเพราะยังมีนักกีฬาไทยอีกหลายประเภทที่ยังมีโปรแกรมแข่งขันในรายการนี้